BioPathBot

Description

Depuis une databiographie suivant le format utilisé sur le wiki (ex: 1890.03.19 / Genève), le BioPathBot est capable d'extraire les informations temporelles et spatiales. Ces deux données forment un tuple et sont parsées de façon suivante :

• La date est formée d'une année, d'un mois et d'un jour. Si des informations venaient à manquer, la date est complétée par défaut avec le mois de janvier et le premier du mois.
• Le lieu est transformé en coordonnées géographiques (utilisant la librairie python geopy)

Ainsi transformées et triées chronologiquement, ces données permettent de générer une carte utilisant basemap, où sont dessinés des points pour marquer les lieux, ainsi que des traits mettant en avant la trajectoire de la personne. Cette carte est ensuite importée sur wikipast puis insérée sur une page annexe.

Par exemple la carte de Jean Tinguely se visualise comme:

Critique

• Peu importe le type de page (une page concernant une personne, un hypermot...), une carte est générée. Donc si une page ne relate pas la vie d'une personne, la carte aura peu de sens.

• Avec l'algorithme actuel, les dates et les lieux sont parfaitement extraits et placé sur la carte. Cependant, si les données ne sont pas suffisamment précises, elles seront approximées (1980 devient 1980.01.01 tandis que le point géographique correspondant à la Suisse sera son centre géographique). Cela peut mener à des erreurs de trajectoire lors du tri chronologique ou simplement à une position différente de la réalité sur la carte.

• S'il existe des événements post-mortem mais que la mort de la personne n'est pas mentionnée ou ne suit pas la convention de l'hypermot Décès, ces données seront aussi extraites et placées sur la carte, alors même que la personne ne se déplace pas.

• Si des événements sont spatialement trop proches, ils vont se superposer sur la carte et il deviendra difficile de retracer les événements d'une façon visuellement claire. Par exemple, pour un trait entre Berne et Lausanne, il sera difficile de juger si une personne a fait plusieurs fois ce même déplacement ou ne l'a fait qu'une seule fois au cours de sa vie.

• Parfois l'outil qui transforme les lieux en coordonnées géographiques crée des erreurs. Par exemple "Rome" devient "Lomé" qui se situe au Togo.

Code

 import urllib.request
 import requests
 from bs4 import BeautifulSoup
 import re
 import math
 import datetime
 from geopy.geocoders import Nominatim
 from mpl_toolkits.basemap import Basemap
 import matplotlib.pyplot as plt
 from colorsys import hsv_to_rgb
 from matplotlib.colors import rgb2hex
 SEGMENTS = 100
 
 # draw plots inline rather than in a seperate window
 %matplotlib inline
 # draw plots bigger
 plt.rcParams["figure.figsize"] = [20.0, 10.0]
 
 user='BioPathBot'
 passw='chkiroju'
 baseurl='http://wikipast.epfl.ch/wikipast/'
 summary='Wikipastbot update'
 protected_logins=["Frederickaplan","Maud","Vbuntinx","Testbot","IB","SourceBot","PageUpdaterBot","Orthobot","BioPathBot","ChronoBOT","Amonbaro","AntoineL","AntoniasBan  deros","Arnau","Arnaudpannatier","Aureliver","Brunowicht","Burgerpop","Cedricviaccoz","Christophe","Claudioloureiro","Ghislain","Gregoire3245","Hirtg","Houssm","Icebak  er","JenniCin","JiggyQ","JulienB","Kl","Kperrard","Leandro   Kieliger","Marcus","Martin","MatteoGiorla","Mireille","Mj2905","Musluoglucem","Nacho","Nameless","Nawel","O'showa","PA","Qantik","QuentinB","Raphael.barman","Roblan11"  ,"Romain Fournier","Sbaaa","Snus","Sonia","Tboyer","Thierry","Titi","Vlaedr","Wanda"]
 depuis_date='2017-05-02T16:00:00Z'
 liste_pages=[]
 for user in protected_logins:
     result=requests.post(baseurl+'api.php?action=query&list=usercontribs&ucuser='+user+'&format=xml&ucend='+depuis_date)
     soup=BeautifulSoup(result.content,'lxml')
     for primitive in soup.usercontribs.findAll('item'):
         liste_pages.append(primitive['title'])
         print(primitive['title'])
 
 names=list(set(liste_pages))
 
 # Login request
 payload={'action':'query','format':'json','utf8':,'meta':'tokens','type':'login'}
 r1=requests.post(baseurl + 'api.php', data=payload)
 
 #login confirm
 login_token=r1.json()['query']['tokens']['logintoken']
 payload={'action':'login','format':'json','utf8':,'lgname':user,'lgpassword':passw,'lgtoken':login_token}
 r2=requests.post(baseurl + 'api.php', data=payload, cookies=r1.cookies)
 
 #get edit token2
 params3='?format=json&action=query&meta=tokens&continue='
 r3=requests.get(baseurl + 'api.php' + params3, cookies=r2.cookies)
 edit_token=r3.json()['query']['tokens']['csrftoken']
 
 edit_cookie=r2.cookies.copy()
 edit_cookie.update(r3.cookies)
 
 #setup geolocator
 geolocator = Nominatim(timeout=10)
 
 
 # upload config
 def uploadMap(filename):
 
     # read local file
     upload_file = open(filename,"rb")
     upload_contents = upload_file.read()
     upload_file.close()
 
     # setting parameters for upload
     # ref: https://www.mediawiki.org/wiki/API:Upload
     payload={'action':'upload','filename':filename, 'ignorewarnings':1, 'token':edit_token}
     files={'file':upload_contents}
 
     # upload the image
     print("Uploading file to %s via API..." % (baseurl+"index.php/Fichier:"+filename))
     r4=requests.post(baseurl+'api.php',data=payload,files=files,cookies=edit_cookie)
 
     # in case of error print the response
     #print(r4.text)
 
 
 def addToPage(name, img):
     title = name + " BioPathBot"
     content = "Fichier:"+ img +""
     pageToChange = requests.post(baseurl+'api.php?action=query&titles='+title+'&export&exportnowrap')
     payload={'action':'edit','assert':'user','format':'json','utf8':,'text':content,'summary':summary,'title':title,'token':edit_token}
     r4=requests.post(baseurl+'api.php',data=payload,cookies=edit_cookie)
 
 # BioPathBot : add line of databiographie to the right page (time and space)
 def getDataFromPage(name):
     data = []
     result=requests.post(baseurl+'api.php?action=query&titles='+name+'&export&exportnowrap')
     soup=BeautifulSoup(result.text, "lxml")
     #soup=BeautifulSoup(result.text)
     code=
     for primitive in soup.findAll("text"):
         code+=primitive.string
 
     # split on list (*)
     lines = code.split("*")
     for line in lines :
 
         # add breaking lines (otherwise will be appened directly in one line)
         line = "\n\n"+line
 
         # get date if exist
         date = re.findall("((?<=\[\[)\d*(\.*\d*\.*\d*)*(?=\]\]))",line)
         dateToAdd = ""
 
         if len(date) != 0 :
             dateToAdd = date[0][0]
 
         # get place if exist
         place = re.findall("(?<=\/\s\[\[)[A-zÀ-ÿ]*(?=\]\])",line)
         location = ""
         if len(place) != 0:
              placeToAdd = place[0]
              location = geolocator.geocode(placeToAdd)
 
         # if both the date and the location are available, append in data array
         if dateToAdd and location:
             dataToAdd = [location.longitude,location.latitude];
             data.append(dataToAdd);
     return data
 
 
 # finds the minimal and maximal longitude and latitude
 def findCorners(pts):
     minlon = maxlon = pts[0][0]
     minlat = maxlat = pts[0][1]
     for p in pts:
         currlon = p[0]
         if currlon<minlon:
             minlon = currlon
         elif currlon>maxlon:
             maxlon = currlon
 
         currlat = p[1]
         if currlat<minlat:
             minlat = currlat
         elif currlat>maxlat:
             maxlat = currlat
 
     return [minlon, maxlon, minlat, maxlat]
 
 # draws the map, some points and the lines
 def drawmap(pts, filename, export=False):
     n_pts = len(pts)
     corners = findCorners(pts)
     m = Basemap(llcrnrlon=corners[0]-1, llcrnrlat=corners[2]-1, urcrnrlon=corners[1]+1, urcrnrlat=corners[3]+1, resolution='i')
     m.drawmapboundary(fill_color='0.6')
     m.drawcountries(linewidth=1.0, color='0.6')
     m.fillcontinents(color='white', lake_color='white')
     for i in range(n_pts-1): # draw lines
         for j in range(SEGMENTS):
             start = pts[i] + (pts[i+1]-pts[i])*(j/SEGMENTS)
             end = pts[i] + (pts[i+1]-pts[i])*((j+1)/SEGMENTS)
             m.plot([start[0], end[0]], [start[1], end[1]], color=hsv_to_rgb((i+j/SEGMENTS)/n_pts, 1, 1))
     for i in range(n_pts): # draw points
         m.plot(pts[i][0], pts[i][1], marker='o', color=hsv_to_rgb(i/n_pts, 1, 1), fillstyle='full', markeredgewidth=0.0)
     if export:
         plt.savefig(filename, bbox_inches='tight')
     plt.show()
 
 
 for name in names:
     image_filename = (name + "_biopath.png").replace(" ","_")
     data = getDataFromPage(name)
     drawmap(np.array(data), image_filename, True)
     uploadMap(image_filename)
     addToPage(name, image_filename)

Groupe

Nom et Prénom	Pseudo
Christophe Badoux	Christophe
Julien Burkhard	JulienB
Kim Lan Phan Hoang	Kl
Robin Lang	Roblan11